Документальный исторический онлайн-проект «Музей и война» — дань уважения памяти и признательности сотрудникам Музея, прошедшим Великую Отечественную войну. Это проект об истории Музея современной истории России и его сотрудников в период с 1941 по 1945 г., о послевоенном восстановлении и о Музее сегодня. Он создан на основе фондовых и архивных материалов ГЦМСИР и задуман как живой архив, данные которого будут обновляться в процессе появления новых материалов.
Первый раздел сайта, «Культурный фронт», рассказывает об истории Музея в военный период и даёт возможность ознакомиться со списком сотрудников, ушедших на фронт. Второй раздел, «Победители», — о послевоенном восстановлении и о сотрудниках-фронтовиках, которые пришли работать в Музей после 1945 г. Раздел «Наследники Победы» содержит информацию о современных выставочных и онлайн-проектах, посвящённых 75-летию Великой Победы, а также об участвовавших в войне родных и близких нынешних сотрудников Музея. Это своего рода виртуальный «Бессмертный полк» Музея современной истории России.